首都医科医院胸外科建于年，是目前国内专门独立从事儿童普胸外科疾病诊治的专业之一，居国内小儿胸外科领域领先地位。胸外科现有正主任医师1名，副主任医师2名，主治医师1名，住院医师4名，设有床位24张。现每年施行胸外科手术量余例。胸外科专业特色：漏斗胸微创NUSS手术，特别是复杂胸壁畸形的微创综合诊治；胸腔/纵隔肿瘤、先天性肺部疾病的胸腔镜微创手术技术。
医院胸外科主要治疗疾病：
(1)胸壁畸形：漏斗胸、鸡胸、叉状肋、Poland综合征等；
(2)先天性肺囊性病：先天性肺气道畸形(先天性囊性腺瘤样畸形)、隔离肺、肺大疱等；
(3)胸部肿瘤：纵隔肿瘤(神经源性肿瘤、畸胎瘤、淋巴管瘤等)、胸壁肿瘤(原始神经外胚层肿瘤、Askin/Ewing瘤等)、肺部肿瘤(胸膜肺母细胞瘤、炎性肌纤维母细胞瘤、肺转移瘤等)；
(4)食管膈肌疾病：食管裂孔疝、后外侧膈疝、胸骨后疝、膈膨升、食管狭窄(气管软骨异位、贲门失驰缓症、食管化学烧伤等)；
(5)其他：胸部外伤、脓胸、胸腔积液、气胸等。
漏斗胸是发病率最高的胸壁畸形，从上世纪80年代始，胸外科采用“胸肋骨V形截骨矫形”治疗漏斗胸，术后效果良好，先后取得了北京市级“漏斗胸科研奖”、“研制漏斗胸器械奖”等两项奖项。年，医院胸外科开始对漏斗胸微创手术进行了探索，于年正式引进漏斗胸微创NUSS手术专用器械及内植入支架。该术式于年由美国DonaldNuss医生首先报道，因其切口小而隐蔽，手术时间短，出血少，术后恢复快，不需要游离胸壁肌肉皮瓣，不需切除肋软骨及胸骨，可以长期保持胸部伸展性、柔韧性、弹性，被称为胸壁矫形手术的革命，在漏斗胸手术治疗历史上具有里程碑意义。经过10余年的经验总结，目前医院胸外科可完成各种复杂、不对称、复发等胸壁畸形手术，并在标准NUSS术式的基础上进行了多项有益的改良，包括手术技术的改良以及手术器械的改良。根据不同类型的漏斗胸，采用不同的手术方式。经过技术改良，手术切口已减小到1cm，切口更加隐蔽，手术更加安全，更加微创。现已实施各种漏斗胸微创NUSS手术余例，手术技术及诊治水平居国内领先，也是世界上医院之一。年，胸外科在NUSS手术治疗漏斗胸的基础上，应用微创NUSS手术原理率先在国内开展微创手术治疗鸡胸，现已实施微创胸骨沉降术治疗鸡胸余例，是世界上最早实施此手术也医院之一。近年来，胸外科专业在国内率先开展应用悬吊法腔镜辅助技术治疗叉状肋，已通过新技术新项目申报。由曾骐教授作为第一发明人申报的国家专利“鸡胸矫形器”已应用到临床。
医院胸外科先后于年、年、年、年、年、年分别在北京、杭州、广州、上海、香港等地举办共六届全国胸壁矫形研讨会暨微创NUSS手术学习班，累计吸引了来自全国各地包括港澳台地区，以及韩国、瑞典、泰国、马来西亚等地学员千余名，会议对规范微创漏斗胸NUSS手术技术，减少手术并发症等起到了积极有益的作用。年Nuss医生特别授权医院为“中国胸壁矫形微创NUSS手术培训中心”。曾骐教授以其精湛的手术技术和丰富的临床经验成为胸壁矫形领域的学术带头人，年被美国BIOMETMICROFIXATION聘为国际培训医生，并成为新一代Pectus手术器械研发团队成员之一，全世界仅6人。
从年起胸外科开展小儿胸腔镜手术，用胸腔镜诊断治疗小儿胸部疾病取得了良好的效果。十余年来不断扩大胸腔镜在小儿胸外科领域的应用，主要包括胸腔镜纵隔肿瘤切除、胸腔镜肺叶切除、膈疝修补等手术。目前约有90%的胸部手术采用微创技术。
目前承担多项北京市医管局、北京市科委、教委等多项研究课题。近年在国内核心期刊发表多篇论文，SCI收录4篇。胸外科专业获得国家专利12项，其中发明专利3项，实用新型专利证书9项。
特色项目：微创胸壁矫形手术(漏斗胸微创NUSS术、鸡胸微创胸骨沉降术等、悬吊腔镜胸壁矫形术)、儿童胸腔镜手术(肺叶切除术、纵隔肿瘤切除术、胸腔肿瘤切除术、膈疝修补术、膈肌折叠术、肺活检术等)
胸外科门诊：周一全天胸外科特需门诊、周三上午胸外科专业门诊、周四上午胸外科特需门诊、周四下午胸外科专业门诊、周五上午胸外科专业门诊。
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