西医治疗
以益生菌调节肠道、解痉止痛等对症治疗为主，合并细菌、病毒感染时可选择抗菌、抗病毒药物治疗，可以短期缓解，但腹痛易反复发作.
中医治疗
肠系膜淋巴结炎是西医的叫法，在中医属于腹痛病的范畴。小儿的脾胃发育不完善，对营养物质的需求量又大，决定了小儿易受内外因素干扰，导致气血运行受阻而致腹痛。①口服中药：肺胃热盛证，采用凉膈散加减，具有清泄肺胃，解毒散结的功效；饮食积滞证，采用保和丸加减，具有消食化积，行气止痛的功效；脾胃虚弱证，采用七味白术散加减，具有健脾行气，和胃止痛的功效。口服中药困难的宝宝，也可辩证选择中成药口服：复方胃蛋白酶散、四磨汤口服液、参苓健脾颗粒、小儿导赤片、小儿化食口服液等。
②小儿推拿：根据腹痛证型选择推拿部位及手法，对于治疗小儿肠系膜淋巴结炎有非常不错的临床效果.
③穴位贴敷：
急性疼痛期予消徵止痛散贴神阙、双天枢，伴有脾胃虚弱、纳差者加用开胃散外贴中脘、足三里或脾腧；伴有纳差、便溏者加用调脾散敷命门健脾开胃。伴便秘、便干者加用润肠通便散敷神阙、双天枢润肠通便。
④中药封包:
选用健脾、理气、止痛中药制成封包，加热后外敷于腹部，一天一次，每次30分钟，可行气止痛，具有立竿见影的效果，多数患儿在使用后一天内感到腹痛明显减轻
⑤灸法：选取胃脘部、神阙以温中散寒，行气止痛，便秘者可选用隔物灸（隔大黄饼灸）以润肠通便，灸法每日1次，每次10～15min，5天—7天一疗程
⑥针刺疗法：主穴取足三里、合谷、中脘。中寒加神阙；食积加内庭；呕吐加内关；腹胀加下脘；气滞加行间；便秘加大肠腧。每日1次，一次行针15分钟，1-2天一次。